info@ipesoft.com
+421 907 703 854
Obchodná 9076/3D
010 08 Žilina
Slovensko
Názov projektu
Integratívna stratégia v rozvoji personalizovanej medicíny vybraných zhubných nádorových ochorení a jej vplyv na kvalitu života
Názov a sídlo prijímateľa
IPESOFT, spol. s r.o.
Bytčická 2
01001 Žilina
Miesto realizácie projektu
SR/ Žilinský kraj/ Žilina
Financovanie projektu
COV
2 371 475,47 €
NFP
1 587 227,05 €
VZ
784 248,42 €
Detail projektu na www.itms2014.sk
https://www.itms2014.sk/projekt?id=76b69a9b-37d2-48a1-9188-68475fa7095b
Informácie o Operačnom programe Integrovaná infraštruktúra 2014 – 2020 nájdete na www.opii.gov.sk
Integratívna stratégia v rozvoji personalizovanej medicíny vybraných zhubných nádorových ochorení a jej vplyv na kvalitu života
Nádorové ochorenia predstavujú obrovskú záťaž pre každú krajinu, nielen v oblasti socioekonomických, ale aj hospodárskych ukazovateľov. Viacerým krajinám tiež chýba objektívna identifikácia počtu nádorových ochorení a databázy údajov relevantných k týmto ochoreniam. Podobne je na tom aj Slovensko. Nielenže zastáva prvé miesta vo výskyte nádorových ochorení (najmä CRC), ale absentuje mu aj racionálny systém dát k týmto ochoreniam (v minulosti fungoval Národný onkologický register, avšak ten teraz nie je aktuálny), resp. niektoré dáta nie sú k vybraným ochoreniam dostupné. SR sa začala aktivizovať v spôsobe manažmentu pacientov s nádorovými ochoreniami. MZ SR vypracovalo národný onkologický program, ktorý podporuje skríning, včasnú diagnostiku a personalizovanú terapiu nádorových ochorení. Nové biomarkery pre včasnú diagnostiku, predikciu a prognózu nádorových ochorení sú veľmi dôležitým článkom na trhu s diagnostickými testami ako aj na trhu vývoja špecifických terapeutických produktov (liekov). Použitie biomarkerov na skríning, diagnostiku, monitorovanie a optimalizáciu liečby má veľmi vysoký potenciál v zlepšení komplexného manažmentu nádorových ochorení. Sú to kľúčové identifikátory vo všetkých štádia ochorenia a ich validácia (nielen laboratórna, ale aj klinická) je nesmierne náročná (či už z hľadiska realizácie ale aj z finančného hľadiska).
Projekt sa realizoval konzorciom partnerov integrujúcich subjekty z oblasti medicíny, subjekty s technickým zameraním ako aj so zameraním na sociológiu. Ambíciou konzorcia bolo identifikovať panely vybraných biomarkerov, validovať ich, overiť ich reálnu použiteľnosť a požiadať o súhlas so zavedením do klinickej praxe. Takýto prístup je oveľa komplikovanejší ako identifikácia a využívanie jedného biomarkera. Panely biomarkerov, ktoré sú výstupom projektu v spojení s komplexným návrhom hodnotenia s využitím IT a s predikovaním spoločenských a hospodársko-ekonomických dopadov po ich zavedení do klinickej praxe predstavujú unikátny výsledok, ktorý bol dosiahnuteľný len v silnom konzorciu partnerov.
Spoločnosť IPESOFT spol. s r.o. sa stala jedným z technických partnerov projektu a je popredným dodávateľov komplexných IT riešení. Jej úlohou a cieľom v konzorciu riešiteľov projektu bol návrh a realizácia aplikačného prostredia pre manažment onkologických pacientov. Pre realizáciu tohto cieľa sa v jej réžií zrealizovali nasledovné projektové aktivity:
1. Návrh vhodnej SW a HW architektúry aplikačného servera pre účely zberu dát v rámci manažmentu starostlivosti o onkologického pacienta. Návrh prezentačnej a riadiacej vrstvy aplikačného servera pre správu s dátami.
V rámci tejto aktivity sa zrealizoval zber, validácia a archivácia diagnostických dát. Následne boli získané dáta analyzované s cieľom identifikovať príslušné dátové toky, komunikačné protokoly a navrhnúť proces čistenia a validácie dát ako aj vhodné metódy spracovania týchto dát v reálnom čase pre potrebu ich ďalšieho spracovania a archivácie.
2. Realizovať aplikačné prostredie t.j. SW aplikáciu pre manažment onkologických pacientov
Cieľom tejto aktivity bolo zrealizovať vhodnú SW a HW architektúru aplikačného servera pre účely zberu dát v rámci manažmentu starostlivosti o onkologického pacienta ako aj zrealizovať prezentačnú a riadiacu vrstvu aplikačného servera pre správu dát podľa požiadaviek ostatných partnerov projektu.
Kľúčovou úlohou IPESOFT spol. s r.o. bolo zabezpečiť príslušnú technologickú podporu pre projekt: zabezpečiť zber, spracovanie, validovanie a archiváciu dát ako aj vytvoriť vhodnú HW a SW infraštruktúru pre prezentovanie a vyhodnocovanie zozbieraných dát vhodnými spôsobmi a metódami.
Po finančnej stránke bol projekt realizovaný s pomocou finančnej podpory z EÚ prostredníctvom OPII v kombinácií s vlastnými prostriedkami prijímateľa a partnerov projektu.
Projekt sa realizoval v súlade so Stratégiou výskumu a inovácií pre inteligentnú špecializáciu SR (RIS3 SK) v oblasti podpory dlhodobého strategického výskumu v doméne „Zdravie obyvateľstva a zdravotnícke technológie“. S ohľadom na aktuálne posilnenie podpory investícií a vedecko-výskumných aktivít v oblasti zdravotníctva má projekt silný potenciál využiteľnosti v oblasti zdravotníctva a biotechnológií s úzkym prepojením na prax prostredníctvom subjektov zabezpečujúcim primárnu zdravotnícku starostlivosť. Projekt sa viaže k hlavnému a vedľajšiemu trendu v produktovej línií „Zdravie obyvateľstva a zdravotnícke technológie“.
Spoločnosť IPESOFT spol. s r.o. pôsobí primárne v oblastiach zameraných na počítačové programovanie, poradenstvo a súvisiace služby v oblastiach energetiky, dopravy a riadenia výroby. Projekt je zameraný na vývoj SW platformy pre manažment onkologických pacientov ako produktu v oblasti IKT, ktorého účelom je priemyselný výskum a experimentálny vývoj softvéru príslušnej HW a SW aplikácie ako aj zabezpečenie potrebného HW vybavenia.
Popis aktuálnej situácie na projekte:
V iniciálnej fáze uvedenej aktivity prebiehala kontinuálna analýza požiadaviek hl. partnera a ostatných partnerov v rámci projektového konzorcia. Pozostávala primárne z oboznámenia sa s metodológiou práce v rámci starostlivosti o onkologických pacientov. Následne sa systematicky pristupovalo k zberu údajov a ich detailnej analýze z hľadiska kvantitatívnych (množstvo/rozsah, časový rozptyl) ako aj kvalitatívnych parametrov (komplexnosť, obsahová analýza, sémantika...). Zrealizovala sa analýza a evaluácia komunikačných a dátových tokov medzi producentom a spracovateľom obsahu. Na základe konzultácií a zozbieraných dát boli vytvorené funkčné požiadavky na dizajn informačného systému (IS), konceptuálne modely, postupy, scenáre a konkrétne prípady použitia (use cases) s cieľom zachytiť a formalizovať zamýšľanú štruktúry systému a zadefinovať požiadavky na prezentačnú vrstvu a interpretáciu zozbieraných dát. V spolupráci s ostatnými členmi konzorcia bol sfinalizovaný a zostavený koncept IS bol následne predmetom testovania a validácie zo strany realizátora/partnera (IPESOFT) ako aj zadávateľa (hl. partnera – Jesseniova lekárska fakulta v Martine).
Obstaranie a nainštalovanie projektovej HW infraštruktúry pre beh systémov LISPER prebehlo v rámci prvej aktivity v priebehu mesiacov 07-10/2022. S ohľadom na časové rámce a procesy spojené s VO boli do obdobia sfunkčnenia projektovej infraštruktúry pre potreby vývoja a testovania prototypov alokované výpočtové kapacity Partnera na existujúcej infraštruktúre.
Finálnym výsledkom prvej aktivity bol funkčný a zdokumentovaný konceptuálny model aplikačného prostredia IS a jeho validácia. Výskumné aktivity boli zavŕšené v mesiaci 01/2023 a ich výstupy boli priebežne aplikované v rámci aktivity experimentálneho vývoja.
V rámci druhej aktivity (experimentálny vývoj) ktorú spol. IPESOFT v rámci projektu realizovala prebiehal primárne vývoj aplikačných modulov, algoritmizácia a samotné programovanie navrhnutých funkcionalít. Ťažiskovou úlohou bolo zúročiť výstupy z prvej aktivity (priemyselný výskum) zabezpečiť prevádzkovú analýzu vstupných dát a komunikačných tokov a v neposlednom rade sfunkčnenie a naimplementovanie vyvíjaného IS na novú HW platformu obstaranú v rámci projektu. V priebehu 3Q-4Q/2022 po realizovaní iniciálnych simulačných a užívateľských testov so súbormi testovacích dát sa podarilo SW aj HW infraštruktúru sprevádzkovať tak, aby umožňovala v rámci produkčnej prevádzky automatizovaný aj manuálny vstup dát do systému. Konfigurácia SW a HW infraštruktúry bola nastavená tak aby umožňovala vstup a spracovanie údajov v reálnom čase. V uvedenom období bezprostredne po dodávke boli projektovým pracovníkom distribuované a nakonfigurované pracovné stanice s príslušnými aplikáciami umožňujúcim vývoj IS LISPER a súvisiacich podporných databázových technológií. Ťažiskovými činnosťami aktivity boli programátorské činnosti spojené s vývojom aplikačnej platformy (dizajn/návrh tabuliek a procedúr, algoritmov, návrh GUI, databázových štruktúr, skriptov, jednotlivých formulárov a pod.). Výsledkom projektovej činnosti je vzájomne prepojený, funkčný aplikačný a databázový server. Vyvinuté modulu spolu vo výsledku tvoria komplexný informačný systém umožňujúci riadený a parametrizovateľný vstup dát, ich spracovanie a vizuálnu interpretáciu.
Časť obstaranej HW platformy bola alokovaná pre potreby zálohovania (spracúvaných dát a vývojového prostredia) a ako vývojové prostredie - „sandbox“ pre potreby testovania, simulácií, výkonnostných testov a pod.
Výsledkom uvedenej aktivity je vybudované komplexné vývojové a testovacie prostredie ako aj produkčný informačný systém umožňujúci spracovávať vstupné dáta (zadávané manuálne alebo importované z med. zariadení). K uvedenému systému je vyhotovená komplexná systémová dokumentácia obsahujúca popis inštalovanej SW a HW infraštruktúry ako aj používateľská dokumentácia pre klientske obslužné činnosti. Po zrealizovaní uvedených aktivít a dosiahnutí projektových míľnikov boli aktivity projektu úspešne ukončené ku dňu 30.6. 2023.